据说古代的人给书起名字的时候非常讲究，比如像《扁鹊内经》、《白氏外经》等书，就是以人的名字命名的，属于带有一些个人的偏见。而在当时“黄帝”二字是个天大的名号，如果能借黄帝之势，把一本书当传作经典，那不是非常的好啊！所以给这本书起名字的人无非是在借“黄帝”的名势。但有一点，至少作者没有给自己留名的私心。
再一个就是中国文化讲究“道统”，就是一切都要按五行生克来。比如说关于谁做黄帝这件事，在古人看来也是天定的。“黄帝”代表“中央之神”，所谓“中央之神”在人们身体里的表现就是脾土。所以《黄帝内经》一书重点在中央脾土，之所以以黄帝为名，就是强调脾胃乃后天之本的思想。
总之来说《黄帝内经》的作者以黄帝为名，一是重视“中央之神”的脾胃，二是借黄帝建立中国一统之势，来表达以这本书来一统天下之医学的决心。